二氧化氯发生器在废水处理中的应用效果比较理想，尤其适合成分相对复杂、对消毒和污染物去除有一定要求的废水场景，具体的效果可以从几个核心的处理方向来看：
- 消毒杀菌效果
二氧化氯可以高效灭杀废水中的细菌、病毒、真菌以及部分芽孢，杀菌的速度快，且受废水的 pH 值影响比较小（在 pH3-9 的范围内都能保持稳定的杀菌效果），在医疗实验室废水、养殖废水这类带有病原微生物的废水处理中，一般投加 5-10mg/L 的二氧化氯，就可以将微生物的灭杀率控制在 99% 以上，满足废水的消毒排放要求。
- 污染物去除效果
- 可以氧化分解废水中的部分难降解有机污染物，比如小分子的酚类、醛类，以及部分有色物质，对于浓度在 50-200mg/L 的低浓度有机废水，能去除 30%-60% 的 COD，同时还可以去除废水的色度，让出水的观感更好；
- 可以将废水中的二价铁、锰离子氧化为高价态的沉淀物，从而完成去除，对于铁锰浓度在 0.5-2mg/L 的废水，去除率可以达到 85% 以上。
- 适用性的优势
和其他的废水消毒设备相比，二氧化氯发生器的体积小，适配中小型的废水处理站，而且可以根据废水的水量、水质，灵活调整二氧化氯的投加量，既可以单独作为消毒单元使用，也可以和生化处理、过滤处理的单元配合使用。
不过它也有一定的局限性：对于高浓度的有机废水，二氧化氯无法完成彻底的降解，只能作为预处理或者深度处理的辅助单元；另外如果废水中含有大量的还原性物质，会消耗大量的二氧化氯，提升使用成本。
